این کلیسا را در قرن ۵ و ۶ میلادی بنا نهاده اند. با توجه به اسناد موجود بنای اصلی کلیسا بارها بر اثر عوامل گوناگون ویران شد، بنای فعلی در سال ۱۸۴۰ میلادی به ابتکار سردار سامسون خان و توسط معماران روسی و فرانسوی ساخته شد. کلیسای هوانس مراغه در زمان حکومت مغول بسیار محبوب بود ولی در زمان حاضر بهدلیل مهاجرت پیروانش به شهرهای دیگر، بدون استفاده باقی مانده است.
این کلیسا در شهر مراغه در استان آذربایجان شرقی قرار دارد. البته هم نام دیگری هم این کلیسا به نام هوانس در نزدیکی ارومیه وجود دارد. هوانس یکی از نامهای حواریون مسیح است.
این کلیسا که حالا در اختیار میراث فرهنگی است، تنها کلیسای مراغه است. بجز برج ناقوس آن و چند نوشته نشانی از کلیسا ندارد. ساختمان مسطتیل شکل آن مرمت و سفید کاری شده و ستونهای چوبی دارد.
بدترین بد سلیقگی در این بنا سر در ورودی آن است که هیچ ارتباطی با فضای کلی این بنا ندارد. متاسفانه با این که این کلیسا در اختیار میراث فرهنگی است ولی در سطح شهر تابلوی راهنمایی برای این کلیسا نصب نشده است ولی روی نقشه گوگل محل آن علامت گذاری شده و قابل جستجو هست.