مسجد میر نطنز در محله کوی میر رو به روی بن بست کوچه میر 4 قرار دارد. (اسم خیابان اصلی که مسجد در آن قرار دارد را از یکی از اهالی پرسیدم گفت مردم خیابان را بیشتر به نام محله کوی میر میشناسند.)
در مسجد بسته بود. کلیددار مسجد یکی از اهالی نطنز است که خانه اش در بن بسته کوچه میر 4 رو به رو است. خانمی آمدند و در را برای ما باز کردند. جلو دیوار مسجد تابلو فلزی اداره میراث فرهنگی شهرستان نطنز بود که روی آن نوشته بود: محراب مسجد میر نطنز.
راهنمای ما آقای حسینی توضیح دادند که ساختمان اصلی مسجد خراب شده و فقط سردر بنا و محراب مسجد میر قدیمی ترین جز مسجد است.
سردر مسجد دارای تزئینات مختصری است و دارای کتیبه که کتیبه آن تقریبا از بین رفته.
محراب مسجد گچبری بسیار زیبا و تماشایی دارد که با توجه به ظرافت های آن, آندره گدار و آرتور پوپ گچبری محراب مسجد را به دوره سلجوقی نسبت داده اند. (امروزه جلو محراب شیشه محافظی قرار داده اند.)
مسجد میر مسجد بسیار کوچکی است که با پرده ای قسمت مردانه و زنانه آن از هم تفکیک شده بود.
در مسجد در اوقات نماز ظهر و عشا باز است و نیازی به هزینه ورودیه ندارد.